Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH4Q9P2E8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms