Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PHRF1Q9P1Y6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PHRF1Q9P1Y6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PHRF1Q9P1Y6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms