Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMG20BQ9P0W2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMG20BQ9P0W2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMG20BQ9P0W2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms