Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD3Q9P035 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms