Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAH9Q9NYC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAH9Q9NYC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms