Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDND1Q9NY35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDND1Q9NY35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms