Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
THUMPD1Q9NXG2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THUMPD1Q9NXG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms