Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED29Q9NX70 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms