Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHBDL2Q9NX52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms