Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARMC1Q9NVT9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms