Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC38A7Q9NVC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A7Q9NVC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms