Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM140Q9NV12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM140Q9NV12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms