Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDP1Q9NUW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDP1Q9NUW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDP1Q9NUW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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