Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTLC3Q9NUV7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC3Q9NUV7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC3Q9NUV7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms