Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCM2LQ9NUG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms