Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GKN1Q9NS71 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms