Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms