Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRAC1Q9NRG0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRAC1Q9NRG0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms