Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS2Q9NR19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms