Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSU72Q9NP77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSU72Q9NP77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSU72Q9NP77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms