Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIAA1549Q9HCM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIAA1549Q9HCM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms