Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARVBQ9HBI1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms