Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP110Q9HB58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP110Q9HB58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP110Q9HB58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms