Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms