Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR55Q9H6Y2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms