Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms