Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4A4

RNPEP, Aminopeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPEPQ9H4A4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPEPQ9H4A4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPEPQ9H4A4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms