Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG5Q9H1Y0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG5Q9H1Y0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms