Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3FQ9H1D9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3FQ9H1D9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms