Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF3Q9GZM5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms