Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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