Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM15Q9C019 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM15Q9C019 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms