Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP1-5Q9BYS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms