Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL13Q9BYD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL13Q9BYD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms