Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms