Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLVAPQ9BX97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLVAPQ9BX97 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms