Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT27Q9BW83 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT27Q9BW83 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT27Q9BW83 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT27Q9BW83 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT27Q9BW83 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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