Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHCHD7Q9BUK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms