Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU70

TRMO, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMOQ9BU70 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMOQ9BU70 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMOQ9BU70 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMOQ9BU70 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms