Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNPY3Q9BT09 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNPY3Q9BT09 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY3Q9BT09 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms