Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRACR2AQ9BSW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRACR2AQ9BSW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms