Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIOK1Q9BRS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms