Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MESP1Q9BRJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MESP1Q9BRJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MESP1Q9BRJ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms