Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TXNDC17Q9BRA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms