Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOPXQ9BPY8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOPXQ9BPY8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOPXQ9BPY8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms