Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF15Q99988 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF15Q99988 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms