Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSG101Q99816 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSG101Q99816 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms