Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PIK3R4Q99570 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PIK3R4Q99570 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PIK3R4Q99570 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms