Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L3Q99457 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L3Q99457 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms