Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HAPLN3Q96S86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAPLN3Q96S86 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms